Druhé kolo testovania obyvateľov na prítomnosť ochorenia COVID-19 sa bude realizovať inak. Na základe rozhodnutia Ústredného krízového štábu SR dostanú výnimku okresy s počtom pozitívnych prípadov nižším ako 0,7 percenta. Testovať sa nebude ani v Bratislave a Košiciach. Celkovo sa tak bude v priebehu 7. a 8. novembra 2020 testovať 45 okresov. „Vzhľadom na to, že pilotné testovanie a tiež prvé kolo celoplošného testovania sa preukázali ako efektívne nástroje v snahe zamedziť šírenie ochorenia medzi našimi obyvateľmi, je dôležité v tomto úsilí nepopúšťať. Potrebujeme stabilizovať všetky regióny a nemôžeme sa uspokojiť s dobrou situáciou v niektorých častiach Slovenska. Veď ako sa hovorí, jedna bitka vojnu nevyhráva,“ zdôvodnil minister obrany SR Jaroslav Naď s tým, že úprimne verí v pochopenie a podporu všetkých, ktorí sa na testovaní podieľajú, a tiež obyvateľov, ktorí sa na ňom majú zúčastniť.Zoznam testovaných okresov:
| Regionálne veliteľstvá | Okresy |
| Malacky | Senica |
| Skalica | |
| Martin | Dolný Kubín |
| Martin | |
| Námestovo | |
| Turčianske Teplice | |
| Michalovce | Humenné |
| Medzilaborce | |
| Michalovce | |
| Snina | |
| Sobrance | |
| Vranov nad Topľou | |
| Prešov | Bardejov |
| Kežmarok | |
| Levoča | |
| Poprad | |
| Prešov | |
| Sabinov | |
| Stará Ľubovňa | |
| Stropkov | |
| Svidník | |
| Rožňava | Gelnica |
| Spišská Nová Ves | |
| Ružomberok | Liptovský Mikuláš |
| Ružomberok | |
| Tvrdošín | |
| Sereď | Dunajská Streda |
| Topoľčany | Partizánske |
| Prievidza | |
| Topoľčany | |
| Trenčín | Bánovce nad Bebravou |
| Ilava | |
| Myjava | |
| Nové Mesto n/V | |
| Považská Bystrica | |
| Púchov | |
| Trenčín | |
| Zvolen | Banská Bystrica |
| Brezno | |
| Detva | |
| Zvolen | |
| Žilina | Bytča |
| Čadca | |
| Kysucké Nové Mesto | |
| Žilina | |
| SPOLU | 45 okresov |